Não se sabe ao certo quais são as causas e os fatores de risco para a FM, porém, compreende-se que distúrbios estressantes pós-traumáticos, acidentes automobilísticos, lesões repetitivas, doenças como infecções virais, lúpus eritematoso sistêmico, síndrome da fadiga crônica e predisposição genética podem estar associados com o início da doença. A ansiedade e distúrbios depressivos podem estar associados com a causa da fibromialgia, pois frequentemente estão sendo observados em pacientes com esse tipo de síndrome. Outros os veem como sintomas da doença.
Além disso, a fibromialgia pode contribuir para o desenvolvimento de fatores de risco cardiovasculares como o sedentarismo, obesidade e doenças advindas da mesma, como dislipidemia, resistência à insulina e hipertensão arterial. No entanto, muitos fatores de risco são modificáveis pela simples mudança no estilo de vida, combatendo e prevenindo as doenças cardiovasculares, além de melhorar os sintomas advindos da fibromialgia como redução da dor nos pontos dolorosos (tender-points), diminuição da rigidez matinal, diminuição da fadiga e redução da ansiedade e depressão.
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